基于不同生长时期香港牡蛎转录组数据分析BMP蛋白家族的表达变化

doi:10.19754/j.nyyjs.20230630028

农业与技术 ›› 2023, Vol. 43 ›› Issue (12): 109-112.DOI: 10.19754/j.nyyjs.20230630028

基于不同生长时期香港牡蛎转录组数据分析BMP蛋白家族的表达变化

农珍珍蒙扬辉陈肇聪蒋美君孙若鹏朱鹏覃波忠钟方杰张斌严雪瑜

1.广西北部湾海洋生物多样性养护重，点实验室/北部湾大学海洋学院，广西软州535011； 2.软州市水产技术推广站，广西软州535000

出版日期:2023-06-30 发布日期:2023-06-30
作者简介:农珍珍(1997-)，女，硕士在读。研究方向：水产养殖与渔业发展；通讯作者严雪瑜(1988-)，女，博士，助理研究员。研究方向：水产动物遗传育种。
基金资助:
广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室开放项目（项目编号：GXKEYLA2020-01);软州市科学研究与技术开发计划项目(项目编号：20223637)；软州市科学研究与技术开发计划项目（项目编号：20221214）

Online:2023-06-30 Published:2023-06-30

摘要/Abstract

摘要： 为探究香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)生长调控关键基因的作用机理，本研究利用转录组高通量测序技术分析骨形态发生蛋白(bone morphogenetic protein,BMPs)家族中的关键差异表达基因在香港牡蛎不同生长时期的表达变化。本研究检测到了5个BMP蛋白家族的基因，并发现BMP1、BMP2、BMP3和BMP7在12M时的表达量低于4M时的表达量，基因时空表达呈下降趋势：而BMP10基因在12M时的表达量高于4M时的表达量，基因时空表达呈上升趋势。研究表明，BMP蛋白家族中的BMP1、BMP2、BMP3、BMP7和BMP1O等基因可能参与了香港牡蛎的生长调控过程。

中图分类号:

S917

. 基于不同生长时期香港牡蛎转录组数据分析BMP蛋白家族的表达变化[J]. 农业与技术, 2023, 43(12): 109-112.

参考文献

[1]《2019中国渔业统计年鉴》[J].世界农业，2020(03)：2. [2]任琰.香港牡蛎与近江牡蛎、葡萄牙牡蛎的种间杂交研究[D].南宁：广西大学，2020. [3]Ravelich S R,Shelling A N,Wells D N,et al.Expression of TGF-B1,TGF-B2,TGF-B3 and the receptors TGF-BRI and TGF-BRII in placentomes of artificially inseminated and nuclear transferderived bovine pregnancies J].Placenta,2006,27 (2-3):307-316. [4]Chin D,Boyle G M,Parsons P G,et al.What is transforminggrowth factor-beta (TGF-B)?[J].British journal of plastic sur-gy,2004,57(3):215-221. [5]周玉娟.合浦珠母贝TGFB信号通路相关基因的克隆及功能研究[D].北京：清华大学，2010 [6]封利颖，郭慧慧，李雪，等。栉孔扇贝骨形态发生蛋白2基因的克隆及表达分析[J].中国海洋大学学报（自然科学版），2013,43(12)：48-55. [7]Chen D I,Zhao M,Mundy G R.Bone morphogenetic proteins[J].Growth factors,2004,22(4):233-241. [8]Bragdon B,Moseychuk O,Saldanha S,et al.Bone morphogenet-ic proteins:a critical review [J].Cellular signalling,2011,23(4):609-620. [9]Aimin L,A N L.Bone morphogenetic protein signalling and verte-brate nervous system development [J].Nature reviews.Neuro-science,2005,6(12). [10]Jia S,Dai F,Wu D,et al.Protein phosphatase 4 cooperateswith Smads to promote BMP signaling in dorsoventral patterning ofzebrafish embryos J ]Developmental cell,2012,22 (5):1065-1078. [11]Ducy P,Karsenty G.The family of bone morphogenetic proteins[J].Kidney interational,2000,57 (6):2207-2214. [12]Miyashita T,Hanashita T,Toriyama M,et al.Gene cloning andbiochemical characterization of the BMP-2 of Pinctada fucata J].Bioscience,biotechnology,and biochemistry,2008,72 (1):37-47. [13]钱雪骏.泥蚶Smad1/5、BMP2/4基因的克隆、表达分析及生长性状相关SNP位点筛选[D].上海：上海海洋大学，2015. [14]罗辉，叶华，肖世俊，等.转录组学技术在水产动物研究中的运用[J].水产学报，2015,39(04)：598-607. [15]张丹，傅建军，朱文彬，等.鳙早期发育阶段的转录组分析[C].江苏省遗传学会.江苏省遗传学会2017年学术研讨会一“技术创新与遗传学发展”论文摘要集，2017：1 [16]李蔚，何苹萍，韦嫔嫒，等。卵形鲳够卵巢不同发育时期的转录组测序分析[J].南方农业学报，2022,53(03)：714-724. [17]严雪瑜，蒋美君，方杰，等.不同苗种来源香港牡蛎的生长差异及基因表达相关分析[J].南方农业学报，2022,53(12):3568-3575. [18] Maeno M,Ying X,Wood T I,et al.Cloning and expression ofcDNA encoding Xenopus laevis bone morphogenetic protein-1 dur-ing early embryonic development J].Gene,1993,134 (2):257-261. [19]雷小灿.BMP1基因在动物卵泡发生过程中的表达模式及功能的初步研究[D].南宁：广西大学，2015. [20]苏壬香.BMP2基因在斑马鱼心脏发育过程中的功能研究[D].长沙：湖南师范大学，2017. [21]艾加林.九孔鲍MSTN、BMP-2基因克隆、表达及SNP位点筛选[D].湛江：广东海洋大学，2018. [22]Daluiski A,Engstrand T,Bahamonde M E,et al.Bone morpho-genetic protein-3 is a negative regulator of bone density [J].Na-ture genetics,2001,27(1):84-88. [23]周代志.合浦珠母贝BMP3和BMP10基因的克隆与功能初步研究[D].上海：上海海洋大学，2016. [24]董迎辉.泥蚶高通量转录组分析及生长相关基因的克隆与表达研究[D].青岛：中国海洋大学，2012. [25]周代志，黄桂菊，刘宝锁，等.合浦珠母贝骨形态发生蛋白10(BP10)基因的克隆与表达分析[J].南方水产科学，2016,12(06):83-90. [26]段胜华.插片后三角帆蚌和褶纹冠蚌生长、育珠性能比较及BP基因的鉴定和功能研究[D].上海：上海海洋大学，2021.

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