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农业与技术 ›› 2023, Vol. 43 ›› Issue (14): 9-13.DOI: 10.19754/j.nyyjs.20230730003

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组学技术在甘薯领域的应用

张倍源 靳艳玲 赵海   

  1. 1.中国科学院成都生物研究所,四川成都610041;2.中国科学院大学,北京100049
  • 出版日期:2023-07-30 发布日期:2023-07-30
  • 作者简介:张倍源(2000-),男,硕士在读。研究方向:环境微生物;通讯作者赵海(1966-),男,硕士,研究员。研究方向:甘薯品 质研究。
  • 基金资助:
    四川省重点研发项目(项目编号:2022YFN0043):国家甘薯产业技术体系(项目编号:CARS-10-GW24)
  • Online:2023-07-30 Published:2023-07-30

摘要: 近年来,随着高通量测序技术的发展,组学技术在甘薯研究领域得到越来越多的应用。本文围绕组学技术在甘薯研究方面的应用,就基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学4个方面进行了总结。在基因组学方面,多个研究团队已经完成了不同甘薯种质或种系的基因组测序和注释工作,重点关注甘薯的遗传起源以及特定功能的基因家族。在转录组学方面,研究者揭示了甘薯抗旱、盐胁迫以及重金属等非生物胁迫和生物胁迫下转录组的差异表达谱,鉴定了一系列与抗性相关的差异表达基因。在代谢组学方面,通常需要与转录组学的分析相结合,通过研究基因表达调控,代谢产物对基因表达的影响,信号通路和酶活性的调节等机制,分析从基因表达到代谢产物的整个流程,以揭示代谢和基因表达之间的相互作用。在蛋白质组学方面,研究者利用TRAQ等定量技术分析不同组织、不同生长条件下的差异表达蛋白,鉴定关键酶和蛋白,预测新的编码基因,完善基因注释,有效补充了基因组和转录组的研究,帮助全面理解甘薯的生长发育和适应机制,并为遗传育种提供重要信息。

关键词: 甘薯;基因组学;转录组学;代谢组学;蛋白质组学

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