主管单位:吉林省科技厅
主办单位:吉林省科学技术信息研究所
合作单位:吉林省科学技术情报学会

农业与技术 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (7): 106-109.DOI: 10.19754/j.nyyjs.20240415021

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绵羊去甲基化酶FT0基因的生物信息学分析

孟金柱 杨显刚 赵园园   

  1. 铜仁学院贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,贵州铜仁554300
  • 出版日期:2024-04-15 发布日期:2024-04-15
  • 作者简介:孟金柱(1987-),男,博士,副教授。研究方向:动物繁殖;通讯作者赵园园(1987-),女,博士,教授。研究方向:动物 遗传与分子育种。
  • 基金资助:
    贵州省科技计划项目(项目编号:黔科合基础[2020]1Y138);贵州省高层次创新型人才培养项目(千层次)(项目编号: 2022-(2020)-044);贵州省重点实验室项目(项目编号:黔科合平台人才[2020]2003号)
  • Online:2024-04-15 Published:2024-04-15

摘要: 为了探究绵羊FTO(Fat mass and obesity--associated protein)基因的结构和功能,试验采用绵羊皮肤组织 RNA-sq获得的CDS序列和生物信息学方法对FTO基因的核苷酸序列的相似性、氨基酸序列、蛋白理化性质、 蛋白二、三级结构、亚细胞定位和互作蛋白进行研究。结果表明,绵羊FT0基因CDS区为1518bp,共编码505 个氨基酸,其中亮氨酸(Lu)含量最多(11.1%),组氨酸(His)含量最少(2.6%);FT0蛋白分子式C26w Hs3N0m1S2,分子的质量为58553.79,理论等电点(p)为5.28,半衰期为30h,结构不稳定,属于亲水性蛋 白,不具有信号肽和跨膜结构域;T0主要分布在细胞外基质中;多肽链中含有43.17%螺旋结构、38.61%无规 则卷曲、11.49%延伸链和6.73%B折叠结构;FTO与FOX01、CREB1、ALKBH8、ALKBH5、YTHDF1、YTHDF3、 YTHDF2、ME"TTL14、WTAP、METTL310个蛋白可能存在互作。说明绵羊的FTO蛋白主要与RNA甲基化调控相 关蛋白互作,为进一步研究其功能提供参考。

关键词: FTO;生物信息学分析;绵羊;RNA甲基化;蛋白互作

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