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绵羊去甲基化酶FT0基因的生物信息学分析
2024, 44(7):
106-109.
DOI: 10.19754/j.nyyjs.20240415021
为了探究绵羊FTO(Fat mass and obesity--associated protein)基因的结构和功能,试验采用绵羊皮肤组织
RNA-sq获得的CDS序列和生物信息学方法对FTO基因的核苷酸序列的相似性、氨基酸序列、蛋白理化性质、
蛋白二、三级结构、亚细胞定位和互作蛋白进行研究。结果表明,绵羊FT0基因CDS区为1518bp,共编码505
个氨基酸,其中亮氨酸(Lu)含量最多(11.1%),组氨酸(His)含量最少(2.6%);FT0蛋白分子式C26w
Hs3N0m1S2,分子的质量为58553.79,理论等电点(p)为5.28,半衰期为30h,结构不稳定,属于亲水性蛋
白,不具有信号肽和跨膜结构域;T0主要分布在细胞外基质中;多肽链中含有43.17%螺旋结构、38.61%无规
则卷曲、11.49%延伸链和6.73%B折叠结构;FTO与FOX01、CREB1、ALKBH8、ALKBH5、YTHDF1、YTHDF3、
YTHDF2、ME"TTL14、WTAP、METTL310个蛋白可能存在互作。说明绵羊的FTO蛋白主要与RNA甲基化调控相
关蛋白互作,为进一步研究其功能提供参考。
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