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主办单位:吉林省科学技术信息研究所
合作单位:吉林省科学技术情报学会

农业与技术 ›› 2025, Vol. 45 ›› Issue (11): 118-123.DOI: 10.19754/j.nyyjs.20250615026

• 畜牧科学 • 上一篇    

基于简化基因组的海南坡鹿亲缘关系分析

李慧明 陈兴永 段春宇 邱深本   

  1. 1.广东科贸职业学院,广东广州510430:2.广州动物园,广东广州510070; 3.陕西能源职业技术学院,陕西咸阳712000
  • 出版日期:2025-06-15 发布日期:2025-06-15
  • 作者简介:李慧明(1985-),女,博士,讲师。研究方向:分子生物学及免疫;通信作者邱深本(1967-),博士,教投。研究方向:畜 牧动物营养与繁育。
  • 基金资助:
    广东省普通高校特色创新类项目(项目编号:2022KTSCX267):广东科贸职业学院“双百行动”专项(项目编号:GDKM2024-22)
  • Online:2025-06-15 Published:2025-06-15

摘要: 基于我国特有一级重点保护动物海南坡鹿(Ceruseldihainanus)简化基因组测序结果,筛选微卫星 (SSR)分子标记用于坡鹿种群亲缘鉴定分析。通过对海南坡鹿总DNA进行提取,使用Illumina平台对基因组进 行测序,利用CERVUS和POPCENE软件分别对海南坡鹿SSR位点特征信息及亲缘关系鉴定进行分析。海南坡鹿 简化基因组共检测到20505个SSR位点,其中19个SSR位点的遗传多样性较高,等位基因数量在2~8个,平均 ))) SSR位点的累积非父排除率分析表明,仅使用4个SSR位点组合对坡鹿亲缘关系鉴定的排除概率在99.9%以上。 本研究建立了一套有效的鹿科动物亲子鉴定的分子标记方法,筛选的SSR分子标记物可有效地用于海南坡鹿的 亲缘分析及家系管理,对合理指导海南坡鹿人工繁育工作,以及在濒危和珍贵鹿科动物的选种育种研究中具有重 要的应用价值。

关键词: 海南坡鹿;基因组;亲子鉴定;微卫星;分子标记开发

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