芝麻Cu/Zm超氧化物歧化酶基因的全基因组鉴定与分析

doi:10.19754/j.nyyjs.20231030011

农业与技术 ›› 2023, Vol. 43 ›› Issue (20): 47-50.DOI: 10.19754/j.nyyjs.20231030011

芝麻Cu/Zm超氧化物歧化酶基因的全基因组鉴定与分析

张文香崔文宁高小宽梁魁景

衡水学院生命科学学院，河北衡水053000

出版日期:2023-10-30 发布日期:2023-10-30
作者简介:张文香(1984-)，女，博士，副教授。研究方向：植物生理学与分子生物学。
基金资助:
衡水学院校级课题（项目编号：2022ZR01);河北省果蔬发酵技术创新中心专项课题（项目编号：2022XZX59);衡水学院高层次人才科研启动基金项目（项目编号：2022GC03);衡水学院校级科研项目（项目编号：2023ZRY03)

Online:2023-10-30 Published:2023-10-30

摘要/Abstract

摘要： 铜/锌超氧化物岐化酶(Cu/Zm-SOD)是植物体内非常重要的一种活性氧清除酶系统，本研究通过blst 的方法，在芝麻全因组水平进行C/Zm-SOD的鉴定。结果显示，芝麻中含有4条C/Zm-SOD,分别命名为 SiCSD1、SiCSD2、SiCSD3、SiCSD4。理化性质分析表明，4种蛋白质均为酸性蛋白质，除SiCSD3外，均为亲水蛋白。结构域分析发现，蛋白质均含有C/Z-S0D特有的结构域和金属离子结合域，但都不具有跨膜结构和信号肽。亚细胞定位预测分析发现，SCSD1-3均定位于叶绿体，SCSD4除了叶绿体，也有可能定位于细胞质。进化树分析发现，SiCSD3与拟南芥ACSD2聚为一支，SiCSD4与拟南芥ACSD3聚为一支，SiCSD1和SiCSD2与烟草NpSODC、番茄SISODC1和SISODC2聚在一个大的分支。以上结果初步表明，SiCSD1-4具有Cu/Zm-SOD共同的理化性质，其序列的鉴定将为后续功能的研究打下基础。

中图分类号:

. 芝麻Cu/Zm超氧化物歧化酶基因的全基因组鉴定与分析[J]. 农业与技术, 2023, 43(20): 47-50.

参考文献

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