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农业与技术 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (23): 20-26.DOI: 10.19754/j.nyyjs.20241215005

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基于16 SrRNA扩增子序列研究平凉地区冬小麦根际土壤微生物群落多样性

周晓伦 李承毅 陈曦 杨玉珍 高文华   

  1. 甘肃医学院基础医学院,甘肃平凉744000
  • 出版日期:2024-12-15 发布日期:2024-12-15
  • 作者简介:周晓伦(1987-),男,硕士,讲师。研究方向:土壤微生物:通讯作者高文华(1993-),女,硕士,讲师。研究方向:病原 生物学。
  • 基金资助:
    甘肃医学院青年科研基金项目(项目编号:GYSF2021-09)
  • Online:2024-12-15 Published:2024-12-15

摘要: 随着冬小麦生长环境的改变、生长季延长、越冬期缩短等,冬小麦种植面积逐年减少,为减少不利因素 对农作物生长的影响,合理开发利用平凉地区土壤微生物群落资源,为微生物群落资源的最大利用作出科学判 断,对捉高农作物产量、增加农民收入具有十分重要的意义。利用国标法测定土壤全氨、全磷、p、脲酶等土 壤理化性质;提取土壤总DNA,通过PCR扩增建立文库,llumina HiSeq25O0测序技术对土样DNA进行16S rRNA基因(V3-V4区)高通量测序;利用生物信息学分析细菌群落的u多样性(包括Chaol、Observed species、 Phylogenetic diversity、Shannon、Simpson和Good”s coverage指数)、B多样性,基于线性判别分析流程分析冬小麦 生长不同时期根际土壤具有显著差异的细菌分类单元;结合土壤理化参数和环境因子Spearman相关性分析可能 影响细菌群落结构变化的主要因子。结果表明:洒盖细菌群落80门989属512种,多样性指数较高,说明冬小 麦根际土壤细菌的丰富度和多样性均处于较高水平。对于门水平、纲水平、属水平优势类群而言,前者为拟杆菌 门、酸杆菌门等;中者为-变形菌纲、拟杆菌纲等;后者主要有酸杆菌属(RB41)和鞘氨醇单胞菌属(Spin- gomonas)。通过主坐标分析(PCoA)和分子方差分析法分析(Amova)表明,细菌群落组成在不同生长时期有 显著差异。冗余分析(RDA)和Spearman相关性分析表明全氨、全磷、pH、脲酶、湿度、温度对细菌群落产生 显著影响。其中,全氨和脲酶是冬小麦根际土壤细菌群落分布的最大影响因素,为认识冬小麦根际土壤细菌群落 的组成,研究影响细菌群落多样性的环境因子提供了理论基础。为平凉地区土壤生态系统和群落资源的保护提供 理论依据。

关键词: 16SRNA;微生物多样性;冬小麦;根际土壤

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